Din punct de vedere ecologic, în judeţul Bihor 75% din principalele cursuri de apă sunt în stare "foarte bună". În judeţul Bihor, Direcţia Apelor Crişuri a monitorizat în prima jumătate a anului peste 1200 km de cursuri de apă. Caracterizarea calităţii apelor de suprafaţă se realizează pe baza rezultatelor obţinute în laboratorul Direcţiei Apelor Crişuri.
Râul Crişul Negru a fost monitorizat în 7 secţiuni, pe o lungime de 187 kilometri. Rezultatul analizelor încadrează râul în clasa I de calitate pe toata lungimea monitorizată. În secţiunea Ştei, pe o lungime de 23 km, râul Crişul Băiţa se încadrează, de asemenea, în clasa I de calitate, adică stare "foarte bună"
Râul Crişul Repede a fost monitorizat în 6 secţiuni, pe o lungime de 187 km. Rezultatele analizelor indică o stare bună a apei, încadrandu-se în clasa a II-a de calitate, adică "stare bună", datorită unor indicatori chimici relevanţi: fenoli, detergenţi şi alţi poluanţi toxici. După restul indicatorilor chimici (salinitatea, regimul de nutrienţi), râul se încadrează în clasa I de calitate pe tot tronsonul monitorizat.
De la Suplacul de Barcău până la frontieră, pe un tronson de 75 km, râul Barcău se încadreaza în clasa a II-a de calitate. În această zonă, datorită activitaţii de extracţie a ţiţeiului, regimul de oxigen din apă, precum şi cantitatea de nutrienţi a suportat modificări. Totuşi, parametrii în care se încadrează menţin o stare bună a cursului de apă. În clasa a III-a de calitate, pe un tronson de 50 km, se află râul Ier (localitatăţile Diosig, Tarcea, Andrid), datorită oxigenului dizolvat.
Cât priveşte pârâul Peţa, a fost monitorizat pe două secţiuni, pe o lungime de 21 km. Rezultatele analizelor indică faptul că pârâul Peţa în zona localităţii Sânmartin, se încadrează în clasa I de calitate, iar în secţiunea aval de municipiul Oradea se încadrează în clasa a II-a de calitate.
Cum a remarcat dl. ing. Ioan Oprean, directorul Direcţiei Apelor Crişuri
"Normele europene, stabilite prin Directiva Cadru privind Apa, impun ca până în 2015 în toate ţările member UE resursa de apă să atingă o stare ecologică "bună", adică să se încadreze în clasa a II-a de calitate. Analizele pe primul semestru din 2008 indică faptul că în judeţul bihor obiectivul de calitate a apelor impus de normele europene este realizabil".