Agenția Națională de Integritate a constatat existența stării de incompatibilitate în cazul lui Marcel Boloş, director general în cadrul Ministerului Transporturilor - Autoritatea de Management pentru Programul Operațional Sectorial Transport, ca urmare a exercitării simultane de funcții.

Potrivit unui comunicat al Agenţiei Naţionale de Integritate, în perioada 9 mai 2012 - 6 iunie 2012, Marcel Boloş a deținut funcția publică de conducere de Director executiv - Direcția Management cu Finanțare Internațională în cadrul Primăriei municipiului Oradea, dar şi funcția de Secretar de stat la Ministerul Dezvoltării Regionale și Turismului. De asemenea, în perioada 1 ianuarie 2013 - 1 ianuarie 2014, acesta a deținut funcțiile publice de conducere de director executiv - Direcția Management cu Finanțare Internațională în cadrul Primăriei municipiului Oradea și director general adjunct la Ministerul Transporturilor. Totodată, în perioada 7 octombrie 2013 - 5 decembrie 2013, Marcel Boloş a deținut funcțiile publice de director general adjunct la Ministerul Transporturilor și Director general în cadrul Institutului Regional pentru Cercetare, Educaţie şi Transfer Tehnologic SA. Conform ANI, Boloş a încălcat următoarele prevederi ale Legii nr. 161/2003: art. 84, alin. (1), lit. c), potrivit căruia "Funcţia de membru al Guvernului este incompatibilă cu: funcția de [...] director general, director [...] la instituțiile publice";  art. 84, alin. (2), potrivit căruia "Funcția de secretar de stat [...] este incompatibilă cu exercitarea altei funcții publice de autoritate, precum și cu exercitarea funcțiilor prevăzute la alin. (1) lit. b) - i)"; art. 94, alin. (1) și alin. (2), lit. a), potrivit căruia "Calitatea de funcționar public este incompatibilă cu orice altă funcție publică decât cea în care a fost numit [...]. Funcționarii publici nu pot deține alte funcții [...] în cadrul autorităților sau instituțiilor publice"; art. 94, alin. (2), lit. c), potrivit căruia "Funcţionarii publici nu pot deţine alte funcţii şi nu pot desfăşura alte activităţi, remunerate sau neremunerate, după cum urmează: în cadrul [...] societăţilor comerciale [...] din sectorul public". "Persoana  evaluată a fost informată despre declanșarea procedurii de evaluare, elementele identificate, precum și drepturile de care beneficiază - de a fi asistată sau reprezentată de un avocat şi de a prezenta date sau informații pe care le consideră necesare, personal ori prin transmiterea unui punct de vedere scris. Marcel Boloş a depus la dosarul de evaluare un punct de vedere în exercitarea dreptului la apărare", se arată în comunicatul transmis de ANI. Potrivit legii, persoana  față de care s-a constatat starea de incompatibilitate este decăzută din dreptul de a mai exercita o funcție sau o demnitate publică pe o perioadă de 3 ani de la data eliberării, destituirii din funcția ori demnitatea publică respectivă sau a încetării de drept a mandatului. Dacă persoana a ocupat o funcție eligibilă, nu mai poate ocupa aceeași funcție pe o perioadă de 3 ani de la încetarea mandatului.