Vicecampioana FC Timişoara şi ocupanta locului 15, Gloria Bistriţa, nu au primit licenţa pentru sezonul 2011/2012 al Ligii I şi au fost retrogradate, prima, în Liga a III-a, iar cealaltă, în eşalonul secund. Decizia a fost luată de Comisia de Apel a Sistemului Naţional de Licenţiere a Cluburilor, în cazul timişorenilor, ca urmare a unor datorii la bugetul statului şi faţă de clubul Benfica Lisabona din transferul fundaşului Laszlo Sepsi (1,2 milioane de euro), în timp ce Gloria Bistriţa a fost sancţionată pentru datorii la buget.

Cele două cluburi primiseră licenţa din partea comisiei de primă instanţă, dar directorul de licenţiere din cadrul FRF, Viorel Duru, a făcut apel. Nici Universitatea Craiova, Victoria Brăneşti, care au şi retrogradat, nu au primit licenţa din cauza datoriilor, în timp ce o altă retrogradată, Unirea Urziceni, nu a depus dosarul de licenţiere. Hotărârea luată de forul federal produce o serie de modificări atât în zona locurilor de cupă europeană, cât şi a retrogradării şi promovării din eşalonul secund. Astfel, FC Vaslui va participa în turul trei preliminar al Ligii Campionilor, Gaz Metan Mediaş va evolua în preliminariile Ligii Europa, iar ultima clasată, Sportul Studenţesc, va juca şi în sezonul viitor al Ligii I. Tabloul complet al formaţiilor româneşti în cupele europene este următorul:

Liga Campionilor: Oţelul Galaţi (grupe), FC Vaslui (turul trei preliminar);

Liga Europa: Rapid Bucureşti şi Steaua Bucureşti (play-off), Dinamo Bucureşti (turul trei preliminar), Gaz Metan Mediaş (turul doi preliminar).