Potrivit prevederilor art. 6 alin. (1) şi (2) din Ordonanţa de Urgenţă a Guvernului nr. 141/2002 privind reglementarea depozitării seminţelor de consum, regimul certificatelor de depozit pentru acestea şi constituirea Fondului de garantare pentru certificatele de depozit, cuantumul taxei pentru eliberarea licenţei de depozit este de 100 lei.
Valoarea taxei pentru eliberarea licenţei de depozit se reactualizează anual cu indicele de inflaţie comunicat de Institutul Naţional de Statistică şi se aprobă prin Ordin comun al ministrului Agriculturii, Pădurilor şi Dezvoltării Rurale şi al ministrului Finanţelor Publice. Taxa pentru eliberarea licenţei de depozit se percepe pentru fiecare licenţă solicitată de către depozitar şi se plăteşte anticipat în contul de venituri ale bugetului de stat 20.16.01.03 "Taxe şi tarife pentru eliberarea de licenţe şi autorizaţii de funcţionare" deschis la unităţile Trezoreriei Statului în raza cărora operatorii economici îşi au sediul social. Ordinul MFP nr. 2425/2009 privind aprobarea cuantumului taxei pentru eliberarea licenţei de depozit a intrat în vigoare la data publicării acestuia (Monitorul Oficial al României, Partea I. nr. 543, din 5 august 2009.